Қазақстан Республикасы Президентінің жанындағы Қазақстан Республикасының Ұлттық ғылым академиясы қызметінің аса маңызды аспектісі -халықаралық ынтымақтастық. Ынтымақтастық білім, ресурстар және сараптамалық тәжірибемен алмасуды қамтамасыз етеді, жаһандық өткір мәселелер бойынша бірлескен зерттеулер жүргізуге мүмкіндік береді, зерттеу сапасына кепілдік беріп, әлеуетті арттыруға және ғылым саласындағы саясатқа ықпал етуді күшейтеді.
Қазақстан Республикасы Президентінің жанындағы Қазақстан Республикасының Ұлттық ғылым академиясы ғылымды дамытудың барлық бағыттары бойынша шетелдік Ұлттық ғылым академияларымен, ғылыми-зерттеу мекемелерімен және басқа да халықаралық ұйымдармен ынтымақтастыққа ашық.
Халықаралық ынтымақтастық шеңберінде Қазақстан Республикасы Президентінің жанындағы Қазақстан Республикасының Ұлттық ғылым академиясы өзінің ғылыми байланыстарын кеңейтуге және Қазақстанның әлемдік ғылыми аренадағы беделін нығайтуға ұмтылады. Шетелде ғылыми қызметпен айналысатын қазақстандық ғалымдармен байланыс орнатуға және оларды отандық ғылымды дамытуға белсенді тартуға ерекше көңіл бөлінеді.
Академиялық серіктестер

Академия наук Турции

Национальная академия наук Украины

Национальная академия наук Таджикистана

Национальная академия наук Кыргызской Республики

Болгарская академия наук

Национальная академия наук Беларуси

Китайская академия наук

Национальная академия наук Грузии

Монгольская академия наук

Российская академия наук

Академия наук Туркменистана

Академия наук Республики Татарстан
Халықаралық серіктес ұйымдар

AASSA – Ассоциация академий наук стран Азии

SC – Международный совет по науке

ANSO – Альянс международных научных организаций

WAS – Академии наук стран третьего мира

AP – Межакадемический Совет по международным научным вопросам

МААН – Международная ассоциация академий наук

TWESCO – Международная Тюркская академия

ААН ОИС – Ассоциация академий наук стран Организации исламского сотрудничества